17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3293 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3293  fimbrial protein  100 
 
 		 342 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0241788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30690  hypothetical protein  32.94 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000866279  hitchhiker  0.000842933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  27.16 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  35.04 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  29.27 
 
 		 180 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6686  fimbrial protein  24.47 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  28.36 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  28.36 
 
 		 171 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  28.36 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.36 
 
 		 171 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  28.36 
 
 		 171 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  28.36 
 
 		 171 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  28.36 
 
 		 171 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  28.36 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  26.52 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  28.36 
 
 		 171 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4842  putative major fimbrial protein  28.01 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>