21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0748 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0748  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0731  hypothetical protein  98.82 
 
 		 169 aa  338  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2530  hypothetical protein  86.31 
 
 		 169 aa  298  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0293088 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3947  hypothetical protein  84.12 
 
 		 171 aa  284  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0812209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0376  hypothetical protein  84.71 
 
 		 170 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0858  hypothetical protein  84.71 
 
 		 170 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159629  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0829  hypothetical protein  84.12 
 
 		 170 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000209543  hitchhiker  0.0000111881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5310  hypothetical protein  61.33 
 
 		 162 aa  191  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  hitchhiker  0.00163358 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6223  hypothetical protein  61.33 
 
 		 162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5723  hypothetical protein  60.67 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34770  hypothetical protein  53.38 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  47.02 
 
 		 547 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2074  hypothetical protein  44.3 
 
 		 339 aa  134  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1252  cyclase/dehydrase  31.54 
 
 		 148 aa  87.4  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000133913  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1450  hypothetical protein  30.87 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00351642  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1229  hypothetical protein  28.86 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323968  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1716  hypothetical protein  32.67 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2547  hypothetical protein  32.64 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3474  hypothetical protein  29.19 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1159  hypothetical protein  42.86 
 
 		 95 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3525  hypothetical protein  27.81 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>