34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0540 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0706  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2889  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0522  hypothetical protein  99.71 
 
 		 346 aa  677    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.724316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1461  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0127  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  679    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3157  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6137  hypothetical protein  43.03 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295579  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7424  hypothetical protein  42.48 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0373604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6506  hypothetical protein  42.92 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5650  hypothetical protein  42.92 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6015  hypothetical protein  42.92 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00375312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3808  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  34.57 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0424  hypothetical protein  26.67 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.938992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0418  hypothetical protein  35.94 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4277  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  35.71 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3650  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.21 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.45 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3280  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.5 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2633  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.5 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1389  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.77 
 
 		 325 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0611  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.27 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3076  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.84 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4271  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  24.83 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  hitchhiker  0.000248822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0636  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.99 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0133  hypothetical protein  32.84 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5272  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.02 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10544  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.85 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.66749e-72  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1730  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.71 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0641  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.51 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3801  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.09 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0139  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  29.13 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1079  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.11 
 
 		 329 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796482 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1121  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.11 
 
 		 329 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>