178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0685 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0685  CvpA family protein  100 
 
 		 164 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  85.37 
 
 		 164 aa  273  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1715  CvpA family protein  96.95 
 
 		 164 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1655  CvpA family protein  96.95 
 
 		 164 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1864  CvpA family protein  96.95 
 
 		 164 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2439  CvpA family protein  96.95 
 
 		 164 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0535  CvpA family protein  96.95 
 
 		 164 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  96.34 
 
 		 164 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  96.34 
 
 		 164 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  78.66 
 
 		 164 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  85.37 
 
 		 164 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  85.37 
 
 		 164 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  85.37 
 
 		 164 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  85.37 
 
 		 164 aa  244  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  85.37 
 
 		 164 aa  244  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  85.37 
 
 		 164 aa  244  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  77.44 
 
 		 164 aa  235  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  78.66 
 
 		 164 aa  233  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  45.68 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  45.34 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  45.96 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  43.56 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2131  Colicin V production protein  44.72 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  40.12 
 
 		 174 aa  98.2  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  37.65 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  35.15 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  38.22 
 
 		 192 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0875  colicin V production protein  38.89 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.592724  normal  0.0357413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  36.23 
 
 		 166 aa  84  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  33.77 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  36.5 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  33.77 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  36.5 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  38.85 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  37.18 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  32.93 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  35.77 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  33.76 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  35.04 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  34.31 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  34.31 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  35.04 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  30.43 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  34.31 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  34.31 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  34.31 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  34.31 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  33.58 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  37.23 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  33.58 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  33.58 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  34.31 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  35.04 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  34.75 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  30.57 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  35.04 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  31.01 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  35.04 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2227  Colicin V production protein  34.94 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630839  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  36.59 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2737  colicin V production protein  34.94 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  33.12 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1909  colicin V production protein  35.21 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.485501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  33.81 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  31.01 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  34.25 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  35.77 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  32.12 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  35.77 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  33.09 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  35.92 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  33.09 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  33.09 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  32.84 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  33.33 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  33.09 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  32.85 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  32.85 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  32.85 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1606  colicin V production protein  32.73 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  37.01 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3057  Colicin V production protein  34.71 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  31.65 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2684  colicin V production protein  36.88 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  31.65 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  31.65 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  31.43 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  35 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>