28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1068 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1068  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.164446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1006  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1314  hypothetical protein  83.82 
 
 		 68 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00260587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0309  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3604  hypothetical protein  56.06 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3415  hypothetical protein  57.58 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.828115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4354  hypothetical protein  53.97 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4024  hypothetical protein  53.97 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  43.08 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1190  SlyX family protein  42.86 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  39.06 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3258  SlyX family protein  37.5 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  40 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3225  SlyX family protein  40.62 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  37.5 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  38.81 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  38.46 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  35.29 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  34.38 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4210  hypothetical protein  35.29 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.906618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  42.65 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  36.76 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  38.24 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  39.44 
 
 		 68 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  35.94 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0103  SlyX  37.68 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5532  SlyX family protein  40 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438123  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  34.38 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>