77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1485 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1485    100 
 
 
1221 bp  2420    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.471497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  99.67 
 
 
1722 bp  2339    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1012    100 
 
 
1176 bp  2331    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0154    100 
 
 
1176 bp  2331    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1039    100 
 
 
1176 bp  2331    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0745499  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  99.67 
 
 
1722 bp  2339    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  99.83 
 
 
1722 bp  2355    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  94.34 
 
 
1740 bp  81.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  91.67 
 
 
2010 bp  63.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  85.53 
 
 
1788 bp  63.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  85.33 
 
 
1719 bp  61.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  88.68 
 
 
1746 bp  58  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  100 
 
 
1746 bp  56  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  89.58 
 
 
1746 bp  56  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  89.58 
 
 
1746 bp  56  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1499  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
780 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0487    100 
 
 
459 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  89.58 
 
 
1842 bp  56  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1816    100 
 
 
459 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207895  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2230  hypothetical protein  100 
 
 
933 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  100 
 
 
1746 bp  56  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0435  serine protease  100 
 
 
459 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  100 
 
 
1755 bp  56  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  100 
 
 
1380 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3406  transposase OrfA  100 
 
 
180 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0440    100 
 
 
108 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2132  hypothetical protein  100 
 
 
117 bp  54  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  100 
 
 
1560 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0587    100 
 
 
228 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  100 
 
 
1380 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1413    100 
 
 
467 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  100 
 
 
1380 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  100 
 
 
1551 bp  54  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2294  ISBma2, transposase  100 
 
 
1530 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104034  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0621    100 
 
 
10059 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1293    100 
 
 
156 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.789728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2261  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2050    100 
 
 
336 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0109  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00195405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1994  ISBma2, transposase  100 
 
 
1530 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.552518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0482    100 
 
 
246 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1076    100 
 
 
294 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1084  hypothetical protein  100 
 
 
324 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1233  ISBma1, transposase, interruption-C  100 
 
 
498 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1297  hypothetical protein  100 
 
 
189 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0173    100 
 
 
90 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0496  hypothetical protein  100 
 
 
297 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1053  hypothetical protein  100 
 
 
1158 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.74132  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1176  hypothetical protein  100 
 
 
651 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162285  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1790  hypothetical protein  100 
 
 
336 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35129  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0685    100 
 
 
297 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0783    100 
 
 
336 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0151  transposase  100 
 
 
213 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1784    100 
 
 
189 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.674387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2899  ISBma1, transposase  100 
 
 
192 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629889  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3070  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0302  amino acid adenylation  100 
 
 
156 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1076    100 
 
 
336 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  100 
 
 
10059 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2024  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  52  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  87.76 
 
 
1806 bp  50.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  93.94 
 
 
1656 bp  50.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  86.79 
 
 
1746 bp  50.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  87.76 
 
 
2013 bp  50.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0191  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
3216 bp  48.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  100 
 
 
22626 bp  48.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  88.64 
 
 
1863 bp  48.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>