26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0503 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2312  hypothetical protein  99.79 
 
 
516 aa  951    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1389  hypothetical protein  99.79 
 
 
519 aa  951    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0998  hypothetical protein  99.79 
 
 
521 aa  951    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1084  hypothetical protein  99.37 
 
 
521 aa  947    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0145  hypothetical protein  99.79 
 
 
478 aa  954    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.955464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0503  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  956    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5234  hypothetical protein  62.66 
 
 
443 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1740  hypothetical protein  60.3 
 
 
443 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130481  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4269  hypothetical protein  32.85 
 
 
433 aa  151  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0275  hypothetical protein  29 
 
 
582 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1166  hypothetical protein  28.25 
 
 
584 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.981297  normal  0.431954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3603  hypothetical protein  28.6 
 
 
489 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0158182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1326  hypothetical protein  27.32 
 
 
584 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157245  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4221  hypothetical protein  29.64 
 
 
424 aa  119  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.287374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3508  hypothetical protein  24.22 
 
 
411 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1246  hypothetical protein  24.86 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422175  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1134  hypothetical protein  24.86 
 
 
411 aa  57  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4644  hypothetical protein  21.47 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.844377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0373  hypothetical protein  23.68 
 
 
416 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1278  hypothetical protein  23.99 
 
 
411 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3727  hypothetical protein  23.86 
 
 
410 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.291811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  21.68 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1399  hypothetical protein  25.77 
 
 
384 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  31.58 
 
 
320 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.39 
 
 
403 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  30 
 
 
720 aa  43.9  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>