40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0408 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0940  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0408  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1473  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1705  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0754  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1683  hypothetical protein  98.66 
 
 
149 aa  277  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2620  hypothetical protein  85.23 
 
 
146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4599  membrane protein  73.81 
 
 
130 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  0.568501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1432  membrane protein  84.21 
 
 
130 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0972  membrane protein  84.21 
 
 
130 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269392  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1454  membrane protein  84.21 
 
 
130 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1375  membrane protein  83.87 
 
 
130 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1335  membrane protein-like protein  82.8 
 
 
129 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2775  hypothetical protein  76.04 
 
 
178 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1861  membrane protein-like protein  82.11 
 
 
136 aa  139  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1352  hypothetical protein  68.42 
 
 
155 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433588  normal  0.260577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1557  hypothetical protein  54.76 
 
 
129 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1577  hypothetical protein  73.68 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  48.67 
 
 
130 aa  106  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1666  hypothetical protein  58.82 
 
 
130 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.361842  hitchhiker  0.00498054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1129  hypothetical protein  47.62 
 
 
146 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00728064  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1996  putative transmembrane protein  58.16 
 
 
130 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1248  transmembrane protein  51.59 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.948754  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  52.08 
 
 
127 aa  93.6  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  48.18 
 
 
115 aa  94  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  42.15 
 
 
135 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2778  hypothetical protein  48.98 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3070  transmembrane protein  44.25 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  hitchhiker  0.000683085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4967  membrane protein-like protein  47.87 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1199  membrane protein-like protein  48.94 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.553066  normal  0.423646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1118  membrane protein-like protein  48.94 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2990  membrane protein-like  45.74 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2770  membrane protein-like protein  51.47 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0344559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  44.68 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1518  putative transmembrane protein  42.73 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3783  membrane protein-like protein  46.36 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1453  membrane protein-like  46.09 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1421  putative transmembrane protein  44.79 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00663896 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  36.28 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0519  putative transmembrane protein  34.25 
 
 
137 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.978517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>