15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0198 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0198  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  340  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4332  hypothetical protein  39.24 
 
 		 91 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.834965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  41.86 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0540  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2731  hypothetical protein  41.77 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2814  pentapeptide MXKDX repeat protein  38.36 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  39.29 
 
 		 109 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2593  hypothetical protein  41.98 
 
 		 93 aa  44.7  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3133  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  55.93 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.821574  normal  0.206734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2931  hypothetical protein  47.37 
 
 		 78 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1511  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  43.62 
 
 		 107 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.144611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1196  pentapeptide MXKDX repeat-containing protein  37.66 
 
 		 91 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0762518  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2530  hypothetical protein  51.92 
 
 		 96 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2991  pentapeptide MXKDX repeat protein  51.92 
 
 		 83 aa  40.8  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2179  hypothetical protein  41.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.565445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>