22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6844 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6844  hypothetical protein  100 
 
 		 30 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  96.67 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  93.33 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  93.33 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  93.33 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  90 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  90 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  83.33 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  76.67 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  76.67 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  80 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  80 
 
 		 73 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  80 
 
 		 73 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  76.67 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  73.33 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  66.67 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  66.67 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3273  protein of unknown function DUF465  60 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  63.33 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  56.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3572  protein of unknown function DUF465  60 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>