16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6382 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6382  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  920    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2529  hypothetical protein  60.12 
 
 		 787 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.74 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5958  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.28 
 
 		 455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207674  decreased coverage  0.00749937 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  56.94 
 
 		 513 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2010  hypothetical protein  44.81 
 
 		 270 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0624267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2481  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.03 
 
 		 497 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0485388  normal  0.126886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3726  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.13 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3969  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.52 
 
 		 232 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1641  hypothetical protein  47.52 
 
 		 219 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5766  hypothetical protein  37.5 
 
 		 211 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.481702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3704  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 272 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3755  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 272 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1624  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.958016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.51 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2857  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 268 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.176917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>