60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4454 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4454  GNAT family acetyltransferase  100 
 
 
163 aa  328  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3933  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
174 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3109  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0976115  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  41.41 
 
 
128 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  28.76 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51560  acetyltransferase  29.01 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.44093e-17  hitchhiker  0.0000412159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0651  acetyltransferase  29.77 
 
 
149 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4220  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3070  acetyltransferase, GNAT family  29.01 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  29.45 
 
 
312 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3981  ATPase central domain-containing protein  32.52 
 
 
471 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2016  GCN5-related N-acetyltransferase  25.18 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  40.32 
 
 
175 aa  44.3  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2056  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.135837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  43.55 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0750  GCN5-related N-acetyltransferase  31.73 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0100469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4042  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.32 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0781  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  28.3 
 
 
298 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  29.5 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2066  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
459 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5921  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
459 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2174  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
459 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2193  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
459 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.533662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2156  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
459 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.67226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  31.21 
 
 
163 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  25.93 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5465  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
459 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114978  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
159 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
173 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0297  aminoalkylphosphonic acid N-acetyltransferase  32.48 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.216533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6006  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.132582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1837  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
458 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1115  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
459 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.383123  normal  0.718299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2623  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
462 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1512  N-acetylglutamate synthase  34.57 
 
 
462 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.374367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
161 aa  40.8  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1751  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
458 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2777  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
458 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2643  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
458 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593428  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  26.32 
 
 
165 aa  40.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  30.34 
 
 
299 aa  40.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2260  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
458 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3059  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
458 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265876  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1532  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
458 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.392031  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2699  N-acetylglutamate synthase  38.98 
 
 
458 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>