27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1581 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1581  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  144  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329633 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  74.29 
 
 		 533 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1585  transposase  74.29 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  71.43 
 
 		 551 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2254  transposase IS66  68.57 
 
 		 538 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505913  normal  0.0115325 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  65.71 
 
 		 549 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3407  transposase  65.71 
 
 		 552 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0688  transposase  65.71 
 
 		 552 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7045  transposase  65.71 
 
 		 552 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4607  transposase and inactivated derivative  65.62 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0215693  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4984  transposase  61.11 
 
 		 535 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  61.11 
 
 		 556 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0784  transposase IS66  62.5 
 
 		 553 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6361  transposase  62.5 
 
 		 527 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0609  transposase  62.5 
 
 		 527 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5388  transposase IS66  59.38 
 
 		 562 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7754  transposase  56.25 
 
 		 540 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  56.25 
 
 		 549 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0399  transposase IS66  48.94 
 
 		 461 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.402856  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4397  transposase IS66  58.82 
 
 		 537 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3700  hypothetical protein  58.82 
 
 		 524 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.751956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  54.55 
 
 		 519 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  54.55 
 
 		 519 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  54.55 
 
 		 517 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4151  posible transposase  47.92 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0115322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  47.22 
 
 		 511 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  50 
 
 		 530 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>