21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34770 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_34770  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  328  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5310  hypothetical protein  52.32 
 
 		 162 aa  160  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  hitchhiker  0.00163358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2530  hypothetical protein  52.35 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0293088 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0748  hypothetical protein  53.38 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.042872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0731  hypothetical protein  52.7 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595275  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3947  hypothetical protein  51.68 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0812209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0829  hypothetical protein  53.69 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000209543  hitchhiker  0.0000111881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0376  hypothetical protein  53.02 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0858  hypothetical protein  53.02 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159629  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5723  hypothetical protein  51.97 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630868  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6223  hypothetical protein  51.97 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  47.02 
 
 		 547 aa  143  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2074  hypothetical protein  46.15 
 
 		 339 aa  130  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1716  hypothetical protein  37.11 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1450  hypothetical protein  34.69 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00351642  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1252  cyclase/dehydrase  34.69 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000133913  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1229  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323968  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2547  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3525  hypothetical protein  34.25 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3474  hypothetical protein  31.74 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2228  hypothetical protein  27.81 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>