30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_01350  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1901  XRE family transcriptional regulator  57.2 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3343  helix-turn-helix domain-containing protein  55.97 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4193  XRE family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177463  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4174  XRE family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.383217  normal  0.0580718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4061  helix-turn-helix domain-containing protein  55.92 
 
 		 245 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.859423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3581  XRE family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 245 aa  274  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.367106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1857  XRE family transcriptional regulator  55.51 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.293754 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3530  hypothetical protein  42.5 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2371  XRE family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000292572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0307  helix-turn-helix domain-containing protein  40.33 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0454  XRE family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.154754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3109  transcriptional regulator  43.51 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3879  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.478998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3152  helix-turn-helix domain protein  40.82 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.769189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3619  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4499  XRE family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0535  XRE family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5081  helix-turn-helix domain protein  39.75 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000569  predicted transcriptional regulator  36.89 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05315  hypothetical protein  37.7 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00769  protein containing HTH domain  36.63 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3062  helix-turn-helix domain-containing protein  38.78 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_003296  RS01701  hypothetical protein  46.91 
 
 		 81 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3283  helix-turn-helix domain-containing protein  29.51 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.323372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1482  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3632  hypothetical protein  28.3 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02091  hypothetical protein  37.1 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003711  hypothetical protein  36.67 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0805647  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003676  hypothetical protein  28.32 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>