39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3210 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3210  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  100 
 
 
150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.938022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  84 
 
 
150 aa  273  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.972498  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0125  GCN5-related N-acetyltransferase  83.33 
 
 
158 aa  259  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1807  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  58.09 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0452712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0805  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  58.09 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1096  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  58.09 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2069  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  58.09 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1736  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  48.53 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.771756  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1733  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  48.53 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247434  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1723  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  48.53 
 
 
145 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.173475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1797  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  47.83 
 
 
145 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1542  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  48.53 
 
 
145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3976  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  37.67 
 
 
143 aa  99  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000658467  normal  0.508858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0154  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0252613  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0462  aminoglycoside acetyltransferase (6) type I  74.42 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2756  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.159719  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1485  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0463  hypothetical protein  49.28 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  30.19 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  29.25 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
345 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  28.81 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3347  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0860  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1341  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0773  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.524081  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
239 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  27.14 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22560  predicted acyltransferase  38.24 
 
 
105 aa  41.2  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  19.73 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  25.53 
 
 
151 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>