37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2453 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2453  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  521  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1678  serine/threonine protein phosphatase family protein  42.51 
 
 
253 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.854416  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28127  predicted protein  29.07 
 
 
338 aa  115  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.16842  normal  0.161123 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47431  predicted protein  26.74 
 
 
412 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33447  predicted protein  28.21 
 
 
359 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0170  metallophosphoesterase  27.17 
 
 
289 aa  85.5  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.76404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0497  metallophosphoesterase  30 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2512  hypothetical protein  27.63 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2463  hypothetical protein  27.63 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00247056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5285  metallophosphoesterase  26.42 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22230  predicted phosphohydrolase  27.41 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484241  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1088  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3411  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.964336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0687  metallophosphoesterase  24.54 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3806  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.02 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0262444  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2093  metallophosphoesterase  26.86 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2139  metallophosphoesterase  26.86 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0227605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2076  metallophosphoesterase  26.86 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0272724  normal  0.436054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2617  metallophosphoesterase  26.22 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0457152  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2016  hypothetical protein  25.1 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00320612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2094  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
293 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.443095  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1505  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2235  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336195  normal  0.178546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12808  hypothetical protein  26.44 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000280695  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4030  metallophosphoesterase  32.33 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2156  metallophosphoesterase  26.22 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2327  metallophosphoesterase  32.33 
 
 
315 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0203181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1725  metallophosphoesterase  23.99 
 
 
328 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  32.12 
 
 
282 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2872  metallophosphoesterase  25.65 
 
 
292 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0306  phosphohydrolase  24.78 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  29.81 
 
 
292 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2606  metallophosphoesterase  25.64 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  32.85 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  24.36 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  23.94 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  20.99 
 
 
424 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>