15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2872 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2872  metallophosphoesterase  100 
 
 
292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2606  metallophosphoesterase  86.19 
 
 
277 aa  490  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0687  metallophosphoesterase  23.86 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2463  hypothetical protein  24.07 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2512  hypothetical protein  24.07 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2016  hypothetical protein  24.7 
 
 
269 aa  57  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00320612  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0306  phosphohydrolase  26.02 
 
 
269 aa  56.6  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  25.2 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2453  hypothetical protein  25.65 
 
 
251 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  26.91 
 
 
281 aa  50.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  29.58 
 
 
299 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  26.91 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  32.8 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  23.86 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4056  metallophosphoesterase  24.05 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>