20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1172 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1172  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  352  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423417  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2948  hypothetical protein  52.33 
 
 		 190 aa  189  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  47.09 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  48.26 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  47.09 
 
 		 178 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  47.4 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  45.35 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  47.13 
 
 		 199 aa  144  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2321  hypothetical protein  41.83 
 
 		 234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  41.38 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  45.28 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  38.18 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  34.83 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  36.97 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1129  hypothetical protein  33.91 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  42.68 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  31.33 
 
 		 107 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  27.78 
 
 		 79 aa  41.2  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  32.86 
 
 		 254 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  32.86 
 
 		 254 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>