21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0228 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0228  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 
267 aa  547  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1335  phospholipase D/transphosphatidylase  64.88 
 
 
215 aa  285  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.602811  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3852  phospholipase D/transphosphatidylase  27.57 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.0109744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1275  hypothetical protein  30.11 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0468  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  23.56 
 
 
247 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2320  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.22 
 
 
241 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2205  phospholipase D/transphosphatidylase  27.27 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460983  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2519  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  25 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796104  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4882  hypothetical protein  44.83 
 
 
234 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1376  phospholipase D/transphosphatidylase  54.35 
 
 
58 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0831  hypothetical protein  36.92 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127965  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0815  hypothetical protein  36.92 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.740919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1045  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  43.1 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0302  phospholipase D/transphosphatidylase  38.96 
 
 
479 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  28.3 
 
 
522 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1926  phospholipase D/transphosphatidylase  40 
 
 
582 aa  45.4  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03300  hypothetical protein  24.26 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  37.29 
 
 
548 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  36.07 
 
 
505 aa  42.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  36.07 
 
 
516 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.84 
 
 
529 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0851513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>