20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1399 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1399  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  1007    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283168  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0313  hypothetical protein  56.96 
 
 
746 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0636  hypothetical protein  54.41 
 
 
759 aa  566  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0987  hypothetical protein  54.95 
 
 
664 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1016  hypothetical protein  54.74 
 
 
664 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1219  hypothetical protein  51.67 
 
 
693 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0168  hypothetical protein  36.13 
 
 
483 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2083  hypothetical protein  36.38 
 
 
615 aa  280  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.999521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2303  hypothetical protein  33.26 
 
 
678 aa  256  8e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00124  hypothetical protein  33.26 
 
 
622 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0183  hypothetical protein  30.1 
 
 
853 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0347623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1188  hypothetical protein  30.26 
 
 
1022 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2116  hypothetical protein  37.38 
 
 
507 aa  203  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.539609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  39.76 
 
 
284 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4496  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.115903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  33.7 
 
 
289 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0344  histidine triad (HIT) protein  36.14 
 
 
268 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  31.4 
 
 
289 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  34.94 
 
 
266 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2115  Peptidase M15A  27.19 
 
 
358 aa  56.6  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>