41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0524 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0524  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  296  9e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0061  transcriptional regulator AbrB  96.21 
 
 		 145 aa  259  8e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0396  transcriptional regulator, AbrB family  78.81 
 
 		 133 aa  201  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0405  transcriptional regulator, AbrB family  78.81 
 
 		 133 aa  201  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.270466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0216  AbrB family transcriptional regulator  75.83 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932065  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5329  transcriptional regulator, AbrB family  79.65 
 
 		 134 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0493  hypothetical protein  61.34 
 
 		 144 aa  155  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.514631  normal  0.108321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1444  transcriptional regulator  55.83 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3125  transcriptional regulator AbrB  52.31 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3802  transcriptional regulator  53.78 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3854  hypothetical protein  53.78 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4400  hypothetical protein  56.52 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000505081  normal  0.726686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1859  transcriptional regulator AbrB  54.39 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1969  transcriptional regulator AbrB  47.93 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2180  hypothetical protein  54.39 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2255  hypothetical protein  50.85 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0192999  normal  0.0349457 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1805  hypothetical protein  42.97 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.730454  normal  0.343994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0897  hypothetical protein  43.22 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18171  hypothetical protein  43.7 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0411  transciptional regulator  45.3 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05991  transcriptional regulator AbrB  46.43 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06291  transciptional regulator  46.43 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11061  hypothetical protein  45.3 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0573  transcriptional regulator AbrB  46.43 
 
 		 118 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.432889  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06381  hypothetical protein  46.43 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05761  hypothetical protein  43.22 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1413  hypothetical protein  44.07 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.48166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0708  hypothetical protein  43.1 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1463  hypothetical protein  42.37 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1525  hypothetical protein  42.02 
 
 		 128 aa  91.3  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.140017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0991  transcriptional regulator AbrB  42.02 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06391  hypothetical protein  41.46 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1774  transcriptional regulator AbrB  42.86 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04971  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04401  hypothetical protein  41.9 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0442  transcriptional regulator AbrB  42.02 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288973  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04671  hypothetical protein  41.18 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05051  hypothetical protein  40.19 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0340173  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04981  hypothetical protein  38.66 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.746916  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1757  transcriptional regulator AbrB  32.62 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0605  transcriptional regulator AbrB  34.86 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.295719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>