15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3878 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3878  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 		 588 aa  1169    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3665  SCP-like extracellular protein  53.75 
 
 		 594 aa  584  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.71 
 
 		 568 aa  111  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.55 
 
 		 461 aa  109  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  27.06 
 
 		 435 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  28.42 
 
 		 1019 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  33.98 
 
 		 264 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  22.01 
 
 		 794 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  29.5 
 
 		 658 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  30.33 
 
 		 335 aa  51.6  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 495 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.58 
 
 		 275 aa  47.8  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0111615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  27.35 
 
 		 475 aa  47  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3066  SCP-like extracellular  33.66 
 
 		 176 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  28.32 
 
 		 232 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>