39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0791 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0791  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  352  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0909  hypothetical protein  81.36 
 
 
212 aa  202  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24100  hypothetical protein  52.94 
 
 
240 aa  114  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.909477  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3581  hypothetical protein  51.35 
 
 
332 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211852  normal  0.13972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26190  hypothetical protein  46.36 
 
 
308 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105599  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5856  hypothetical protein  50.51 
 
 
492 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0414  hypothetical protein  51.96 
 
 
279 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0502  hypothetical protein  49.07 
 
 
279 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498242  decreased coverage  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8900  hypothetical protein  47.06 
 
 
278 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3930  hypothetical protein  47.47 
 
 
264 aa  101  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8087  hypothetical protein  47.46 
 
 
343 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0235  hypothetical protein  46.08 
 
 
272 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4418  hypothetical protein  45.45 
 
 
301 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277724  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0819  hypothetical protein  44.79 
 
 
256 aa  99  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0154  hypothetical protein  44.76 
 
 
411 aa  97.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0138641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3293  hypothetical protein  49.02 
 
 
267 aa  95.9  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.262546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4184  hypothetical protein  42.86 
 
 
268 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.134001  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31380  hypothetical protein  47.3 
 
 
338 aa  91.7  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.56193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0747  hypothetical protein  46.94 
 
 
310 aa  91.3  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011814  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10894  hypothetical protein  41.98 
 
 
262 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00892613  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1712  hypothetical protein  42.2 
 
 
308 aa  89  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.986402  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1239  hypothetical protein  40.71 
 
 
299 aa  88.2  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0967814  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2929  hypothetical protein  47.3 
 
 
331 aa  87.8  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.490815  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4471  hypothetical protein  44.33 
 
 
257 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4854  hypothetical protein  44.33 
 
 
257 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0646326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4558  hypothetical protein  44.33 
 
 
257 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0576894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0485  hypothetical protein  43.69 
 
 
308 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0815  hypothetical protein  44.34 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04170  hypothetical protein  48.89 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0243871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0849  hypothetical protein  47.3 
 
 
303 aa  81.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  decreased coverage  0.00865222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5039  hypothetical protein  39.05 
 
 
275 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134563 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2046  hypothetical protein  40.82 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0108  hypothetical protein  42.27 
 
 
357 aa  78.6  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34000  hypothetical protein  41.49 
 
 
329 aa  77  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.263655  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0829  hypothetical protein  47.83 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0723  hypothetical protein  35.56 
 
 
468 aa  71.6  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4728  hypothetical protein  37.07 
 
 
407 aa  68.6  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0008  hypothetical protein  31.46 
 
 
395 aa  65.5  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3165  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>