23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0658 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0658  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.870127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1621  protein of unknown function DUF1458  67.69 
 
 
68 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.694094  normal  0.69633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2262  protein of unknown function DUF1458  61.54 
 
 
68 aa  84  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  59.09 
 
 
70 aa  78.2  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  52.24 
 
 
67 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  53.85 
 
 
69 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2258  hypothetical protein  47.76 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266107  normal  0.0441451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  37.88 
 
 
67 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  36.36 
 
 
67 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  36.36 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3035  protein of unknown function DUF1458  34.33 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962791  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  30.3 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  39.68 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  39.68 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  30.65 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  35.94 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  35.38 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11529  hypothetical protein  34.92 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1944  hypothetical protein  39.68 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307456  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  33.87 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  35.38 
 
 
68 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1147  hypothetical protein  38.1 
 
 
70 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0963984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>