60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0335 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  670    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  67.16 
 
 		 350 aa  401  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20110  hypothetical protein  48.63 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252423  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3272  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  49.39 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000123433  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  47.98 
 
 		 372 aa  219  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  39.05 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  39.35 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  40.13 
 
 		 363 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  38.78 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  38.73 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  37.25 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  36.93 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  36.18 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  37.46 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  36.54 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  37.13 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  37.93 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  34.26 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  34.17 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  41.75 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  28.74 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.08 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  28.81 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  34.85 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.19 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.69 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.37 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.18 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  26.12 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.4 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.46 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  33.12 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.79 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4412  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.1 
 
 		 403 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0300  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.81 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2757  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.13 
 
 		 396 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133725 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.85 
 
 		 403 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01905  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  26.47 
 
 		 397 aa  46.2  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.77 
 
 		 403 aa  46.2  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.67 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4292  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.25 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1436  monoxygenase  35.85 
 
 		 416 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3032  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  35.85 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210165  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5334  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.85 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2178  monoxygenase  35.85 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0862  monoxygenase  35.85 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1771  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.29 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426084  normal  0.166679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3970  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.87 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2904  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.9 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000160937  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2901  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.64 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.99 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6843  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.99 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4265  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.82 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.184931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0315  acyl-CoA dehydrogenase-like  32.14 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  34.91 
 
 		 423 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  24.88 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1870  monoxygenase  34.91 
 
 		 423 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0550  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.91 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0453  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.91 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>