51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1355 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1355  Cna B domain protein  100 
 
 		 751 aa  1545    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000416795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08160  putative collagen-binding protein  35.36 
 
 		 1195 aa  193  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000954131 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01370  putative collagen-binding protein  31.06 
 
 		 1207 aa  140  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0900922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0796  Cna B domain protein  28.48 
 
 		 1256 aa  138  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  26.06 
 
 		 1093 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  25.65 
 
 		 1055 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  25.09 
 
 		 1093 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18990  putative collagen-binding protein  22.97 
 
 		 1266 aa  90.1  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5126  cell wall surface anchor family protein  27.62 
 
 		 714 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5165  cell wall surface anchor family protein  26.45 
 
 		 627 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4726  cell wall surface anchor family protein  27.03 
 
 		 718 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.757625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4741  cell wall surface anchor family protein  26.16 
 
 		 718 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5153  cell wall surface anchor family protein  27.03 
 
 		 718 aa  80.9  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4884  cell wall surface anchor family protein  26.45 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5258  cell wall surface anchor family protein  26.45 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  26.54 
 
 		 745 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.19 
 
 		 1112 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.77 
 
 		 971 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  26.51 
 
 		 969 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  26.51 
 
 		 969 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  26.18 
 
 		 853 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  28.61 
 
 		 1804 aa  68.6  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1510  Cna B domain protein  22.95 
 
 		 1022 aa  66.6  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.681138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  24.18 
 
 		 771 aa  66.2  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  24.62 
 
 		 1307 aa  64.3  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  24.42 
 
 		 3393 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  25.14 
 
 		 729 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  24.24 
 
 		 3333 aa  62  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.04 
 
 		 3486 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  25.59 
 
 		 2179 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0413  Cna B domain-containing protein  29.66 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  25.22 
 
 		 2136 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.08 
 
 		 1328 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  23.93 
 
 		 3242 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  26.14 
 
 		 731 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  23.6 
 
 		 3190 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  23.1 
 
 		 3210 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  24.33 
 
 		 1508 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  23.69 
 
 		 882 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1612  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.02 
 
 		 723 aa  53.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0909  Cna B domain protein  22.24 
 
 		 1888 aa  52.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.67463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  24.41 
 
 		 2272 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  23.65 
 
 		 3392 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  28.57 
 
 		 1888 aa  51.6  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  40.62 
 
 		 563 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  40.62 
 
 		 563 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  26.49 
 
 		 724 aa  47.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  24.19 
 
 		 1066 aa  47.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  30.97 
 
 		 928 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  28.83 
 
 		 495 aa  45.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  34.18 
 
 		 1108 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>