15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2096 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 511 aa  1018    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0062  polysaccharide biosynthesis protein  37.77 
 
 		 510 aa  342  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0651262  normal  0.28777 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1606  putative transmembrane protein  28.8 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.650131 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1406  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 		 502 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286894 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 517 aa  67  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  22.76 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  22.3 
 
 		 522 aa  57  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 514 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 499 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  19.82 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 494 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  23.26 
 
 		 525 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>