21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1987 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1987  squalene-hopene cyclase-like protein  100 
 
 		 333 aa  692    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.374107  normal  0.15857 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1274  hypothetical protein  36.62 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1459  hypothetical protein  29.7 
 
 		 761 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1146  hypothetical protein  28.9 
 
 		 499 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.837479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2834  hypothetical protein  28.32 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184431  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1124  hypothetical protein  26.24 
 
 		 507 aa  94.7  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1414  hypothetical protein  29.47 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1123  hypothetical protein  26.47 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0211  hypothetical protein  26.24 
 
 		 590 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0829  hypothetical protein  23.8 
 
 		 497 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0632  hypothetical protein  25 
 
 		 739 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173824  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4048  cycloartenol synthase-like protein  20.36 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2004  hypothetical protein  23.7 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0480626  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  22.39 
 
 		 827 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1835  squalene-hopene cyclase  29.79 
 
 		 667 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  24.76 
 
 		 631 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2556  squalene cyclase  26.24 
 
 		 653 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  30.28 
 
 		 695 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20760  squalene-hopene cyclase  23.94 
 
 		 598 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2873  squalene cyclase family protein  22.38 
 
 		 670 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1608 aa  42.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>