27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6825 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6825  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  531  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  36.44 
 
 		 270 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0858561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1649  hypothetical protein  29.09 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  26.92 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5098  hypothetical protein  27.57 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  27.31 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4526  hypothetical protein  25.41 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4613  hypothetical protein  25.41 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4909  hypothetical protein  25.41 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  35.29 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  26.46 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5596  hypothetical protein  34.12 
 
 		 439 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00840265  normal  0.0208396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4353  hypothetical protein  24.37 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  30.37 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  21.76 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10832  hypothetical protein  38.89 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  28.21 
 
 		 405 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4985  hypothetical protein  29.07 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  29.17 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  25.51 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2361  hypothetical protein  28.37 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0463376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  26.16 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0849  hypothetical protein  38.24 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  22.49 
 
 		 366 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  32.93 
 
 		 583 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3936  hypothetical protein  38.89 
 
 		 312 aa  42.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3546  hypothetical protein  34.85 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.341161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>