224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4850 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4850  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
204 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1606  MaoC domain protein dehydratase  46.62 
 
 
153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00168031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  41.73 
 
 
153 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 
156 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  39.55 
 
 
151 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 
152 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  41.54 
 
 
194 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  41.96 
 
 
151 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0292  Enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
162 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000103389  hitchhiker  0.0000892169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  41.84 
 
 
155 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  41.18 
 
 
151 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  42.11 
 
 
151 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  40.44 
 
 
151 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
150 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  38.52 
 
 
151 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  39.71 
 
 
155 aa  99  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  39.69 
 
 
150 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  39.69 
 
 
150 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  39.69 
 
 
150 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3967  Enoyl-CoA hydratase  41.91 
 
 
150 aa  98.2  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4397  Enoyl-CoA hydratase  39.42 
 
 
156 aa  98.2  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  38.46 
 
 
151 aa  97.8  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  39.42 
 
 
151 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3353  MaoC domain protein dehydratase  40.46 
 
 
161 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7557  MaoC-like dehydratase  37.5 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  40 
 
 
151 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  41.04 
 
 
150 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  39.69 
 
 
150 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3655  MaoC domain protein dehydratase  41.67 
 
 
162 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104771  normal  0.224277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  44.66 
 
 
168 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2479  MaoC domain protein dehydratase  38.64 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
151 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3206  MaoC-like dehydratase  38.64 
 
 
166 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  40.46 
 
 
162 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  41.18 
 
 
152 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1649  dehydratase  37.68 
 
 
152 aa  92.8  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195889  normal  0.818072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2249  MaoC-like dehydratase  38.64 
 
 
154 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2169  dehydratase  32.87 
 
 
161 aa  92  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  38.46 
 
 
154 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  38.46 
 
 
154 aa  92  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4012  Enoyl-CoA hydratase  39.26 
 
 
160 aa  92  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  45.28 
 
 
162 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3635  dehydratase  37.5 
 
 
158 aa  91.7  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4909  Enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
163 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  39.55 
 
 
148 aa  91.3  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1788  MaoC domain-containing protein  41.91 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2724  Enoyl-CoA hydratase  44.76 
 
 
160 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0179226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
150 aa  90.5  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  49.49 
 
 
151 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3837  MaoC-like dehydratase  40 
 
 
151 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 
153 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  36.88 
 
 
157 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  49.49 
 
 
151 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0126  enoyl-CoA hydratase  40.74 
 
 
152 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.787557 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  39.13 
 
 
153 aa  90.5  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5029  MaoC domain protein dehydratase  38.64 
 
 
166 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  43.4 
 
 
159 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  34.78 
 
 
150 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  37.04 
 
 
151 aa  89.7  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  45.45 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  39.16 
 
 
158 aa  88.6  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  42.65 
 
 
152 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0620  Enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 
151 aa  88.2  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  37.68 
 
 
151 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3765  nodulation protein N  40.46 
 
 
162 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  37.68 
 
 
151 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  39.86 
 
 
152 aa  87.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  35.66 
 
 
151 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0180  MaoC-like dehydratase  38.96 
 
 
158 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000686309  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  36.23 
 
 
151 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2253  dehydratase  42.31 
 
 
158 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.608983  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1617  MaoC-like dehydratase  42.31 
 
 
158 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2229  dehydratase  42.31 
 
 
158 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3089  MaoC-like dehydratase  38.03 
 
 
160 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.767095  normal  0.110769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3583  nodN-like protein  33.82 
 
 
159 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.234832 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  33.95 
 
 
164 aa  85.1  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  43.85 
 
 
160 aa  84.7  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0237  MaoC-like domain-containing protein  41.26 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1362  MaoC domain protein dehydratase  31.69 
 
 
151 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3180  MaoC-like dehydratase  37.14 
 
 
153 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  34.81 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1048  dehydratase  41.54 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232986  normal  0.177681 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3764  dehydratase  34.31 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.51064  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1105  nodulation protein N  37.4 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  36.64 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0908  putative nodulation protein N  39.71 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0968  nodulation protein N, putative  39.71 
 
 
158 aa  82  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0773042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  39.81 
 
 
151 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2906  MaoC domain-containing protein dehydratase  44.86 
 
 
158 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1389  dehydratase  41.22 
 
 
158 aa  82  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1034  dehydratase  39.85 
 
 
151 aa  82  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248212  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  36.23 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1577  dehydratase  36.69 
 
 
154 aa  81.3  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  35.04 
 
 
152 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2797  MaoC-like dehydratase  37.67 
 
 
163 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5640  Enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  40.77 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  41.54 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  42.31 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>