61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3135 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3135  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 		 288 aa  551  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0924  NAD_Gly3P_dh, NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.43 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6793  beta-hydroxyacid dehydrogenase  30.18 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1707  dehydrogenase  29.5 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1842  dehydrogenase  29.5 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841158  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6789  beta-hydroxyacid dehydrogenase  29.29 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1568  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  34.18 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4106  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.2 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  0.625281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5355  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  42.17 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5062  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  42.17 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4974  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  42.17 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6352  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.39 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5073  NAD_Gly3P_dh, NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.78 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938009  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6317  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.04 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0850  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  35.9 
 
 		 273 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5363  NAD_Gly3P_dh, NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.68 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2232  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.670475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4330  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  30.88 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6157  NAD_Gly3P_dh, NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.57 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.738427  hitchhiker  0.00164861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6605  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.57 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4340  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  33.89 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.380878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4427  NAD_Gly3P_dh, NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.87 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0219002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4331  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  36.46 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4950  NAD_Gly3P_dh, NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.57 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0289  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  38.42 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4105  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  40.25 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.323887  normal  0.638201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4072  NAD_Gly3P_dh, NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.28 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5061  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.12 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4973  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  31.12 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5354  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.12 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4080  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  28.67 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07905  oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01250)  30.57 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.223398  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3786  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  36.99 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162808  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2115  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  30.14 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0575  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.52 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3295  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.47 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3563  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.99 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.874045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3562  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  27.37 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.436255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2798  oxidoreductase, putative  26.5 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35900  putative dehydrogenase  27.11 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000183972  hitchhiker  2.30641e-17 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3884  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  27.14 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2974  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  34.05 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.251673  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0076  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.56 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2413  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.72 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0175  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  30.81 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.490662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0051  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  26.63 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  34.85 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2984  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  24.41 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0425  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  33.12 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2972  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.93 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.856928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3685  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  53.19 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000821613  hitchhiker  0.000000000000410603 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1645  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.62 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.717747  hitchhiker  0.0000336643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1857  3-hydroxyacid dehydrogenase  24.39 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.341144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2396  6-phosphogluconate dehydrogenase  25.24 
 
 		 478 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0271  oxidoreductase  29.53 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00375643  unclonable  0.00000071713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3206  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.28 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.308365 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3011  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.62 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0565  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  39.62 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1751  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  37.68 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3252  6-phosphogluconate dehydrogenase  35.16 
 
 		 463 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2221  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  27.72 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>