29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2856 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2856  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0229131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4646  hypothetical protein  68.08 
 
 
228 aa  284  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.045555  normal  0.138689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3681  hypothetical protein  62.9 
 
 
228 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143848  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  41.05 
 
 
235 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35630  hypothetical protein  34.33 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3905  esterase  33.48 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1866  esterase  31.2 
 
 
246 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.157989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24510  hypothetical protein  30.53 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  29.57 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  31.54 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1935  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.985478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  30.24 
 
 
256 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  29.27 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  30.24 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  30.24 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  30.08 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  31.06 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
235 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4323  esterase  26.83 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359116  normal  0.0128308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  24.69 
 
 
278 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 
240 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
324 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.69 
 
 
2762 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
248 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  36 
 
 
667 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
275 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
275 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
275 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>