More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2078 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2078  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
452 aa  894    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1799  Aldehyde Dehydrogenase  72.67 
 
 
452 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2059  betaine-aldehyde dehydrogenase  71.18 
 
 
455 aa  634    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.807209  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2042  betaine-aldehyde dehydrogenase  71.18 
 
 
455 aa  634    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.57203 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2105  betaine-aldehyde dehydrogenase  71.18 
 
 
455 aa  634    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0684833  normal  0.0301817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4063  betaine-aldehyde dehydrogenase  73.17 
 
 
454 aa  631  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136485  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2280  betaine-aldehyde dehydrogenase  73.05 
 
 
458 aa  621  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1635  aldehyde dehydrogenase  71.46 
 
 
464 aa  608  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.766709  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12874  aldehyde dehydrogenase aldC  68.96 
 
 
455 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1850  betaine-aldehyde dehydrogenase  71.84 
 
 
453 aa  595  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.92194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1759  Betaine-aldehyde dehydrogenase  71.71 
 
 
448 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2586  betaine-aldehyde dehydrogenase  71.33 
 
 
459 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3194  betaine-aldehyde dehydrogenase  66.29 
 
 
453 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4414  Betaine-aldehyde dehydrogenase  55.13 
 
 
452 aa  441  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  49.78 
 
 
478 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.8 
 
 
498 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.08 
 
 
492 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  45.9 
 
 
483 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  44.86 
 
 
502 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  43.11 
 
 
488 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.3 
 
 
487 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  45.9 
 
 
483 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.69 
 
 
496 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.33 
 
 
488 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.3 
 
 
496 aa  365  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  45.05 
 
 
505 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
488 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
488 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  45.45 
 
 
483 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
488 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
488 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
488 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  42.92 
 
 
473 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  42.16 
 
 
497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
490 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  43.11 
 
 
501 aa  354  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  41.79 
 
 
488 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.9 
 
 
484 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  42.98 
 
 
524 aa  352  7e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  41.3 
 
 
488 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  43.58 
 
 
494 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  41.79 
 
 
506 aa  350  4e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 
494 aa  348  8e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4738  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.75 
 
 
507 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.38 
 
 
493 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4650  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.75 
 
 
507 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  43.08 
 
 
485 aa  346  4e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.18 
 
 
474 aa  346  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.14 
 
 
494 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.45 
 
 
494 aa  345  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.68 
 
 
508 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  43.05 
 
 
497 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5033  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
507 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  43.05 
 
 
483 aa  344  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  42.32 
 
 
490 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.27 
 
 
493 aa  343  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.56 
 
 
494 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
494 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  41.59 
 
 
492 aa  342  7e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.3 
 
 
496 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.6 
 
 
494 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  42.6 
 
 
494 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  42.6 
 
 
494 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  42.6 
 
 
494 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  42.6 
 
 
494 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
491 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.6 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.98 
 
 
495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  41.79 
 
 
494 aa  339  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.01 
 
 
509 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  42.6 
 
 
494 aa  339  7e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.23 
 
 
494 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
500 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3524  aldehyde dehydrogenase  43.28 
 
 
505 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00723314  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.01 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
491 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.07 
 
 
492 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.92 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6857  aldehyde dehydrogenase  45.04 
 
 
502 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0656347  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  41.01 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.16 
 
 
494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.85 
 
 
490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.96 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  42.61 
 
 
504 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0142  aldehyde dehydrogenase  44.18 
 
 
489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 
500 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 
510 aa  336  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4237  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
482 aa  335  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.279293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  39.69 
 
 
497 aa  335  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  41.08 
 
 
499 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31630  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.6 
 
 
491 aa  335  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>