61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1386 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  64.58 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  58.33 
 
 		 145 aa  167  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  55.24 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  51.75 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  54.48 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  53.47 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  55.41 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  50 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  49.31 
 
 		 145 aa  140  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  47.92 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  47.22 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  50.68 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  50.68 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  45.83 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  47.18 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  46.53 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  46.53 
 
 		 145 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  46.53 
 
 		 145 aa  129  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  44.06 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  44.06 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  39.29 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  38.89 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  38.57 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  38.57 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  38.57 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  36.88 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  37.14 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  38.57 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  38.57 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  38.57 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  37.14 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  32.86 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  32.86 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  32.86 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  34.97 
 
 		 160 aa  87  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  32.06 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  31.94 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  32.62 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  31.91 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  32.64 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  29.37 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  28.24 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  29.2 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  30.08 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  26.28 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  26.85 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  26.85 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  30.22 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>