299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0410 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0410  thiazole biosynthesis family protein  100 
 
 
262 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188046  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34630  thiazole-phosphate synthase  83 
 
 
261 aa  400  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.087197  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4388  thiazole biosynthesis family protein  78.97 
 
 
263 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3035  thiazole biosynthesis family protein  76.52 
 
 
272 aa  354  6.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2781  thiazole synthase  74.9 
 
 
252 aa  351  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0710  thiazole synthase  76.83 
 
 
265 aa  348  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.528279  normal  0.0428851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0537  thiazole synthase  77.64 
 
 
253 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0547  thiazole synthase  77.64 
 
 
253 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0559  thiazole synthase  77.64 
 
 
253 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3746  thiazole biosynthesis family protein  74.09 
 
 
256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10422  thiazole synthase  76 
 
 
252 aa  341  8e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0958619  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1042  thiazole synthase  72.87 
 
 
266 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0195  thiazole synthase  77.64 
 
 
256 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5999  thiazole biosynthesis family protein  69.26 
 
 
296 aa  329  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3118  thiazole biosynthesis family protein  72.18 
 
 
252 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0092  thiazole biosynthesis family protein  68.95 
 
 
281 aa  322  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1338  thiazole biosynthesis family protein  72.11 
 
 
264 aa  322  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.98593  hitchhiker  0.000526454 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0987  thiazole synthase  68.83 
 
 
262 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151267  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4883  thiazole biosynthesis family protein  68.02 
 
 
260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3886  thiazole biosynthesis family protein  69.33 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4277  thiazole biosynthesis family protein  67.92 
 
 
259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165036  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0914  thiazole biosynthesis family protein  67.07 
 
 
254 aa  301  9e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0775  thiazole biosynthesis family protein  62.75 
 
 
291 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1458  thiazole biosynthesis family protein  67.83 
 
 
276 aa  298  6e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172305  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07980  thiazole-phosphate synthase  68.29 
 
 
272 aa  298  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000818659  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2500  thiazole synthase  64.75 
 
 
276 aa  297  9e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000745865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2779  thiazole synthase  68.51 
 
 
273 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169105  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0493  thiazole biosynthesis family protein  70.04 
 
 
269 aa  285  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01720  thiazole-phosphate synthase  65.16 
 
 
268 aa  278  5e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0666  thiazole synthase  57.43 
 
 
260 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0348700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2225  thiazole biosynthesis family protein  59.6 
 
 
263 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.797646  normal  0.127357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0653  thiazole synthase  56.63 
 
 
260 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0614883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0852  thiazole synthase  55.82 
 
 
267 aa  276  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0578  thiazole biosynthesis family protein  58.33 
 
 
269 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.793856  hitchhiker  0.0079237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3659  thiazole synthase  56.22 
 
 
260 aa  270  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3475  thiazole synthase  56.97 
 
 
258 aa  270  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0655077  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0603  thiazole biosynthesis family protein  57.94 
 
 
273 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.230256  normal  0.0569304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0614  thiazole biosynthesis family protein  57.94 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.243407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  56.4 
 
 
347 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0588  thiazole synthase  56.69 
 
 
260 aa  268  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1284  thiazole biosynthesis protein ThiG  55.94 
 
 
270 aa  266  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1346  thiazole synthase  59.04 
 
 
257 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3874  thiazole synthase  57.32 
 
 
259 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6769  thiazole biosynthesis family protein  58.08 
 
 
265 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2934  thiazole synthase  56.63 
 
 
260 aa  261  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00258312  hitchhiker  7.11375e-16 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0243  thiazole synthase  56.85 
 
 
258 aa  261  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1335  thiazole synthase  58.23 
 
 
257 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0200731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1433  thiazole synthase  58.23 
 
 
257 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2518  thiazole synthase  58.23 
 
 
257 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02980  thiazole synthase  55.2 
 
 
264 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7516  thiazole biosynthesis family protein  58 
 
 
265 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0761271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0480  thiazole synthase  56 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0280  thiazole synthase  57.32 
 
 
259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3719  thiazole biosynthesis family protein  55.28 
 
 
258 aa  258  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.782272  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0364  thiazole synthase  55.24 
 
 
265 aa  258  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  56.97 
 
 
326 aa  257  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3503  thiazole biosynthesis family protein  52.47 
 
 
269 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0361  thiazole synthase  55.2 
 
 
264 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148225  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01841  thiazole synthase  56.86 
 
 
264 aa  257  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0212  thiazole synthase  56.1 
 
 
261 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0036  thiazole synthase  55.6 
 
 
259 aa  257  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.739485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3190  thiazole biosynthesis family protein  55.73 
 
 
264 aa  257  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4104  thiazole biosynthesis family protein  56.35 
 
 
272 aa  257  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225759  decreased coverage  0.005774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2097  thiazole biosynthesis family protein  56 
 
 
272 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0808416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4167  thiazole synthase  54.8 
 
 
264 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.64186  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04980  thiazole synthase  55.6 
 
 
265 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3236  thiazole biosynthesis family protein  56.18 
 
 
264 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260368  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0343  thiazole synthase  56.07 
 
 
271 aa  255  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3856  thiazole synthase  56.07 
 
 
271 aa  254  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0451  thiazole synthase  56.07 
 
 
271 aa  254  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000248099 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2061  thiazole synthase  56.57 
 
 
275 aa  254  8e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.864021  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1983  thiazole synthase  56.57 
 
 
275 aa  254  9e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1824  thiazole biosynthesis family protein  56.13 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2464  thiazole biosynthesis family protein  54.9 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2399  thiazole synthase  56.97 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3403  thiazole synthase  59.59 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.876898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0579  thiazole biosynthesis family protein  53.52 
 
 
267 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0216  thiazole synthase  55.28 
 
 
260 aa  252  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0034  thiazole synthase  55.73 
 
 
262 aa  251  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4004  thiazole biosynthesis family protein  52.85 
 
 
256 aa  250  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4035  thiazole synthase  52.85 
 
 
256 aa  250  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4740  thiazole synthase  53.6 
 
 
264 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.270441 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0793  thiazole biosynthesis family protein  54.4 
 
 
260 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.372773  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0643  thiamin biosynthesis protein ThiG  54.4 
 
 
260 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.924132  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  54.76 
 
 
329 aa  250  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0434  thiazole biosynthesis protein ThiG  53.6 
 
 
264 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5330  thiazole synthase  51.95 
 
 
264 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0625  thiazole biosynthesis family protein  55.47 
 
 
257 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1269  thiazole synthase  55.24 
 
 
267 aa  250  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0262061  hitchhiker  0.00290038 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03867  thiazole synthase  52.85 
 
 
256 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5104  thiazole synthase  52.73 
 
 
270 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.433901  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4977  thiazole synthase  52.73 
 
 
270 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5154  thiazole synthase  52.73 
 
 
270 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.65179 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03820  hypothetical protein  52.85 
 
 
256 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00362  thiazole synthase  52.03 
 
 
255 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2470  thiazole biosynthesis family protein  54.03 
 
 
255 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4481  thiazole synthase  52.85 
 
 
256 aa  249  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4532  thiazole synthase  52.85 
 
 
256 aa  248  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4224  thiazole synthase  52.85 
 
 
256 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1143  thiazole synthase  52.61 
 
 
263 aa  248  5e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>