15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4179 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4179  membrane lipoprotein lipid attachment site  100 
 
 		 216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.51948  hitchhiker  0.00159684 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6800  hypothetical protein  48.7 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2652  hypothetical protein  39.57 
 
 		 193 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.584434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2319  hypothetical protein  40.36 
 
 		 193 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0175398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1536  hypothetical protein  46.72 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.418133 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0077  type IV conjugative transfer system protein TraV  31.48 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4007  hypothetical protein  28.23 
 
 		 383 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503267  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0369  sex pilus assembly protein  40.48 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4219  hypothetical protein  43.24 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.650672  normal  0.513979 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3778  hypothetical protein  24.2 
 
 		 161 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69135  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4225  hypothetical protein  23.91 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1082  conjugal transfer protein TraV, putative  27.59 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.53395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2161  hypothetical protein  29.51 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0254  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5370  Type IV conjugative transfer system protein TraV  31.15 
 
 		 337 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.312286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>