27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4087 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_4087  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  319  8e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.399189  normal  0.196197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3435  hypothetical protein  96.25 
 
 
160 aa  289  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167424  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  59.48 
 
 
156 aa  195  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  58.82 
 
 
156 aa  191  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4964  hypothetical protein  57.89 
 
 
156 aa  188  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.698378 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3289  hypothetical protein  61.43 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0867592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2737  hypothetical protein  59.21 
 
 
156 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3396  hypothetical protein  58.39 
 
 
156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1290  hypothetical protein  53.85 
 
 
157 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3214  hypothetical protein  53.85 
 
 
157 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3097  hypothetical protein  56.67 
 
 
153 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0901  hypothetical protein  58.96 
 
 
239 aa  166  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0678724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5390  hypothetical protein  54.86 
 
 
155 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0782  hypothetical protein  58.09 
 
 
155 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.571559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1980  hypothetical protein  58.09 
 
 
155 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.232355  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2077  hypothetical protein  58.09 
 
 
155 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531924  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0674  hypothetical protein  58.09 
 
 
155 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.015637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0562  hypothetical protein  58.09 
 
 
155 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0492  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  58.09 
 
 
277 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1599  hypothetical protein  57.46 
 
 
153 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688282  normal  0.585844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  48.05 
 
 
157 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5166  hypothetical protein  55.97 
 
 
155 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0225  hypothetical protein  45.51 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00533526  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0659  hypothetical protein  42.11 
 
 
169 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.217066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4068  hypothetical protein  35.04 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1666  hypothetical protein  27.45 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1987  hypothetical protein  30 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>