20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2715 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2715  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  315  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000424232  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2195  hypothetical protein  83.95 
 
 
159 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0026  hypothetical protein  60.55 
 
 
151 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0028  hypothetical protein  60.55 
 
 
151 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.897017  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0027  hypothetical protein  60.55 
 
 
151 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  hitchhiker  0.000412505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5391  hypothetical protein  59.63 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1464  hypothetical protein  55.1 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1173  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  86.3  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  47.83 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1252  hypothetical protein  44 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  55.56 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  45.36 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0043  hypothetical protein  51.06 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1643  hypothetical protein  72.22 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.139577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0147  hypothetical protein  40.62 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4498  hypothetical protein  41.89 
 
 
156 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225753  normal  0.0328772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4365  hypothetical protein  41.89 
 
 
156 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19784  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1676  hypothetical protein  38.6 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.381455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2266  twin-arginine translocation pathway signal  31.1 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0477922  normal  0.880081 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2327  hypothetical protein  40.98 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>