30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2448 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  708    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  61.26 
 
 		 334 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  61.54 
 
 		 334 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  62.65 
 
 		 342 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  60.06 
 
 		 334 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  63.21 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  60.69 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  58.97 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  60.54 
 
 		 300 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  48.96 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  48.94 
 
 		 374 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  48.96 
 
 		 368 aa  318  7e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  35.13 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  35 
 
 		 310 aa  186  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  46.38 
 
 		 247 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  37.03 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  37.3 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  34.43 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  67.65 
 
 		 136 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  32.31 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  30.43 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  30.56 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  31.83 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  28.63 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  33.87 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  28.71 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  27.07 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  35.42 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2639  phage-related protein endonuclease-like protein  26.95 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0591  hypothetical protein  27.71 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>