40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1522 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1522    100 
 
 		 225 bp  446  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1753  transposase, IS4 family protein  88.11 
 
 		 984 bp  192  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.808639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0575    85.05 
 
 		 987 bp  151  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0218438  normal  0.0799551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3395  transposase, IS4 family protein  84.54 
 
 		 987 bp  143  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  83.69 
 
 		 960 bp  97.6  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  83.69 
 
 		 960 bp  97.6  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  82.98 
 
 		 984 bp  89.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5648  transposase IS4 family protein  85.39 
 
 		 963 bp  73.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  81.29 
 
 		 963 bp  69.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  81.29 
 
 		 1218 bp  69.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  81.29 
 
 		 963 bp  69.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  81.29 
 
 		 981 bp  69.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01973  hypothetical protein  81.29 
 
 		 216 bp  69.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0141734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  81.29 
 
 		 990 bp  69.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  81.29 
 
 		 984 bp  69.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  86.67 
 
 		 960 bp  69.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  85.9 
 
 		 996 bp  67.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  87.88 
 
 		 963 bp  67.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04727  ISXoo6 transposase  81.6 
 
 		 810 bp  65.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.714363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04736  ISXoo6 transposase  80.58 
 
 		 924 bp  61.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0618  ISRSO18-transposase protein  87.3 
 
 		 963 bp  61.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5627    80.77 
 
 		 495 bp  60  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5898    87.27 
 
 		 602 bp  54  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00519  ISXoo6 transposase  79.86 
 
 		 924 bp  54  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0915    82.42 
 
 		 979 bp  54  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2927  transposase, IS4 family protein  84 
 
 		 960 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  82.56 
 
 		 981 bp  52  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  85.96 
 
 		 981 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1557  transposase, IS4 family protein  82.72 
 
 		 963 bp  50.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2494  transposase, IS4 family protein  82.72 
 
 		 963 bp  50.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0455823  decreased coverage  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3460  transposase, IS4 family protein  82.72 
 
 		 963 bp  50.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2004  transposase, IS4 family protein  82.67 
 
 		 981 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.094383  normal  0.686139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1459  transposase, IS4 family protein  82.67 
 
 		 981 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0590  transposase, IS4 family protein  82.67 
 
 		 981 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.605879  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  89.74 
 
 		 993 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2954  transposase, IS4 family protein  82.67 
 
 		 963 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3096  transposase, IS4 family protein  82.67 
 
 		 981 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3367  transposase, IS4 family protein  82.67 
 
 		 981 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105389  normal  0.324658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3426  transposase, IS4 family protein  82.67 
 
 		 981 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3766  transposase, IS4 family protein  82.67 
 
 		 981 bp  46.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>