61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_R0026 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_R0026  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t26  tRNA-Cys  89.71 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0032  tRNA-Cys  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0035  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.497187  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0030  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.581991  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0034  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0020  tRNA-Cys  88.33 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.219554  normal  0.362228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0035  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0036  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0022  tRNA-Cys  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0035  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0037171  hitchhiker  0.000312186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0022  tRNA-Cys  86.67 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0049  tRNA-Cys  86.67 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0037  tRNA-Cys  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0501912  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15500  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07200  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.867766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16770  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196388  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0017  tRNA-Cys  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0042  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0630788 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10760  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0456446  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0030  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000324699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0027  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000465456  normal  0.0215874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0031  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0028  tRNA-Cys  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0031  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.931849  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0023  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125865  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0031  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0028  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259946  normal  0.0657688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0024  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500819  normal  0.307833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0029  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0039  tRNA-Cys  90.24 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00256025  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0002  tRNA-Cys  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0040  tRNA-Cys  87.76 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00117723  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0042  tRNA-Cys  90.24 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000509201  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13880  tRNA-Cys  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0819816  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0036  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.381254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0025  tRNA-Cys  87.76 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0045  tRNA-Cys  90.24 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0629972  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0042  tRNA-Cys  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178543  normal  0.586426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0039  tRNA-Cys  90.24 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000510746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0035  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0034  tRNA-Cys  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000888056 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07687  tRNA-Cys  85 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0025  tRNA-Cys  90 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0026  tRNA-Cys  90 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.619128 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0032  tRNA-Cys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0038  tRNA-Cys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0015  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04005  tRNA-Cys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000662406  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0036  tRNA-Cys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0694  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 1092 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101106  normal  0.0226571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2286  hypothetical protein  82.43 
 
 		 462 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00240664  hitchhiker  0.00043215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0038  tRNA-Cys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0112511  hitchhiker  0.000384671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0016  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0855316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0035  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0019  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0015  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0045  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.34247  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14033  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000415175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0025  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.083387  hitchhiker  0.000430374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16740  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186273  normal  0.0595565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>