16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0754 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0754  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1507  hypothetical protein  50.25 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1378  DSBA oxidoreductase  38.27 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3711  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 		 195 aa  45.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0949861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4196  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  40.26 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2900  DSBA oxidoreductase  41.05 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0500  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2386  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.99345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.21 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0023  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2624  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.730832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>