15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3123 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3123  transport-associated protein  100 
 
 
160 aa  303  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.355874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3317  transport-associated  91.19 
 
 
160 aa  235  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3231  transport-associated  91.82 
 
 
160 aa  233  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.324384  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6332  hypothetical protein  42.14 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.24237  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5032  transport-associated  34.62 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.815416  normal  0.551678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  37.88 
 
 
409 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4475  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5516  transport-associated protein  36.13 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.428699 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2774  hypothetical protein  45.59 
 
 
96 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6562  transport-associated  35.48 
 
 
160 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6276  transport-associated  36.29 
 
 
179 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0105604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3840  hypothetical protein  51.39 
 
 
361 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.483504 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6151  transport-associated  34.68 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379338  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6544  transport-associated  35 
 
 
136 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483761  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1287  transport-associated  34.17 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.740475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>