49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2361 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2361  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1503  type IV pilus assembly PilZ  94.07 
 
 		 118 aa  226  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1598  type IV pilus assembly PilZ  92.37 
 
 		 118 aa  223  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1508  type IV pilus assembly PilZ  75 
 
 		 131 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3408  type IV pilus assembly PilZ  37.74 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0420248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3472  type IV pilus assembly PilZ  37.74 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3328  hypothetical protein  37.74 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  37.35 
 
 		 843 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3392  type IV pilus assembly PilZ  40.91 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1622  type IV pilus assembly PilZ  33.65 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1523  2-alkenal reductase  33.7 
 
 		 759 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1964  response regulator CheY  30.56 
 
 		 244 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0489  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 214 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4722  type IV pilus assembly PilZ  36.99 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.992615  normal  0.959626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2803  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.7 
 
 		 237 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0586673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1519  2-alkenal reductase  32.14 
 
 		 778 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1614  2-alkenal reductase  32.14 
 
 		 779 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  30.56 
 
 		 248 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2350  DnaK family protein  32.14 
 
 		 782 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.646727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1407  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  29.46 
 
 		 237 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000138709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4589  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  26.73 
 
 		 239 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3439  hypothetical protein  34.15 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0514  hypothetical protein  31.13 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0854508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2331  2-alkenal reductase  31.53 
 
 		 778 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0761037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2419  2-alkenal reductase  31.53 
 
 		 771 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0536577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1573  type IV pilus assembly PilZ  32 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2856  type IV pilus assembly PilZ  32.61 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1962  type IV pilus assembly PilZ  30.89 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  0.739612 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1356  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6446  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  25.93 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3410  type IV pilus assembly PilZ  30.49 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.595597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2041  type IV pilus biogenesis protein pilZ  25.26 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2304  putative type IV pilus biogenesis protein pilZ  30.26 
 
 		 108 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3501  type IV pilus assembly PilZ  34.62 
 
 		 185 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.424652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1007  type IV pilus assembly PilZ  32.86 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1915  type IV pilus assembly protein PilZ, putative  27.47 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1590  type IV pilus assembly PilZ  27.47 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0382259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1984  type IV pilus assembly PilZ  27.78 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.748677  normal  0.0111146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4361  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.77 
 
 		 493 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.710841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2646  type IV pilus assembly PilZ  23.16 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.109453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1635  type IV pilus assembly PilZ  29.33 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1414  type IV pilus assembly PilZ  23.36 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.152869  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1608  type IV pilus assembly PilZ  31.08 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0391991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4150  Type IV pilus assembly PilZ  30.67 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3825  type IV pilus biogenesis protein PilZ  33.33 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0373515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4333  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  34.33 
 
 		 248 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4356  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  34.33 
 
 		 248 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1581  type IV pilus assembly PilZ  23.16 
 
 		 108 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.875524  normal  0.520302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>