13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3439 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3439  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  219  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0078  hypothetical protein  61.32 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2361  hypothetical protein  34.15 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6010  type IV pilus assembly PilZ  31.33 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1523  2-alkenal reductase  32.18 
 
 		 759 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1503  type IV pilus assembly PilZ  32.93 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  33.8 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  32.56 
 
 		 843 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1598  type IV pilus assembly PilZ  32.93 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  32.39 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6446  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  28.97 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3328  hypothetical protein  30.48 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1964  response regulator CheY  29.63 
 
 		 244 aa  40  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>