20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3474 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009469  Acry_3474  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.498948  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4477  hypothetical protein  38.71 
 
 
181 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.320227  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4327  hypothetical protein  39.52 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457545  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1002  hypothetical protein  39.52 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4780  hypothetical protein  40.87 
 
 
180 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472606  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0291  hypothetical protein  39.42 
 
 
174 aa  82  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0267  hypothetical protein  39.42 
 
 
174 aa  82  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.708651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  34.09 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0557516 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  34.09 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  34.09 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3117  hypothetical protein  36.07 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6297  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3004  putative lipid carrier protein-like protein  34.95 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4227  hypothetical protein  39.76 
 
 
177 aa  58.5  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2400  putative lipid carrier protein-like protein  33.98 
 
 
190 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4295  putative lipid carrier protein-like  38.68 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  22.3 
 
 
227 aa  42.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2111  hypothetical protein  35 
 
 
141 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342906  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4662  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3585  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.837033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>