20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3410 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3410  hypothetical protein  100 
 
 
601 aa  1212    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581563  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  26.89 
 
 
770 aa  150  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  24.53 
 
 
780 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  27.64 
 
 
780 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  30.09 
 
 
656 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  32.74 
 
 
651 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  34.78 
 
 
612 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  32.74 
 
 
1156 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  32.74 
 
 
651 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  30.77 
 
 
684 aa  58.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  29.82 
 
 
586 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  30.7 
 
 
689 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  29.2 
 
 
684 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  29.2 
 
 
684 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  30.7 
 
 
652 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  29.2 
 
 
683 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  26.96 
 
 
620 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  35.71 
 
 
696 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  27.27 
 
 
688 aa  44.3  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0535  hypothetical protein  30.43 
 
 
382 aa  44.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>