24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1278 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1278  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
429 aa  879    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
878 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
3145 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  24.18 
 
 
1252 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.64 
 
 
810 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.14 
 
 
988 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 
1371 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.34 
 
 
632 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.08 
 
 
1056 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
1121 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2610  tetratricopeptide TPR_2  21.65 
 
 
269 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104861  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.74 
 
 
1022 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
1252 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  41.07 
 
 
1221 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4942  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
133 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00284868  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  24.73 
 
 
572 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
1737 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  22.22 
 
 
1098 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 
284 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  27.5 
 
 
704 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
374 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  35.38 
 
 
1331 aa  43.5  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
318 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  25.24 
 
 
456 aa  43.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>