18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0207 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  663    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1088  hypothetical protein  39.37 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.454901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1758  hypothetical protein  37.16 
 
 
306 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.404134  normal  0.0201554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2001  hypothetical protein  31.51 
 
 
296 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0885  hypothetical protein  29.75 
 
 
296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2000  putative signal peptide  27.27 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  38.1 
 
 
288 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6545  hypothetical protein  24.86 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688518  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6259  hypothetical protein  24.28 
 
 
298 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3232  hypothetical protein  22.99 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.389417  normal  0.383811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1460  putative signal peptide  25.22 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00422609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4285  hypothetical protein  24.46 
 
 
298 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46217  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4081  hypothetical protein  24.46 
 
 
298 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  32.43 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  32.5 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  35.38 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  28.7 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  24.53 
 
 
306 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>